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Publicación anticipada – Nuevo genotipo de Coxiella burnetii que causa la fiebre epizoótica de la fiebre Q en roedores, norte de Senegal – Volumen 29, Número 5 – Mayo de 2023 – Journal of Emerging Infectious Diseases

Descargo de responsabilidad: los artículos de lanzamiento anticipado no se consideran versiones definitivas. Cualquier cambio se reflejará en la versión en línea en el mes en que se publique oficialmente el artículo.


Afiliaciones de autor: Centro Interdisciplinario de Investigación Médica de Franceville, Franceville, Gabón (J. Mangombi-Pambou); Universidad de Aix-Marseille, Marsella, Francia (J. Mangombi-Pambou, C. Labarrere, P.-E. Fournier, J. Delerce, F. Fenollar, O. Mediaannikov); Instituto Hospitalario Universitario Méditerranée Infection, Marsella (J. Mangombi-Pambou, C. Labarrere, P.-E. Fournier, F. Fenollar, O. Mediaannikov); Centre de Biology pour la Gestion des Populations, Montpellier, Francia (L. Granjon); Biologie des Populations Animales Sahelo-Soudaniennes, Dakar, Senegal (M. Kane, Y. Niang)

Coxiella Burnetti Es el agente causal de la fiebre Q, una enfermedad zoonótica mundial. La enfermedad puede ser aguda (relativamente benigna) o crónica (con una amplia gama de manifestaciones clínicas que pueden conducir a una alta tasa de mortalidad en humanos) (1). Los seres humanos se infectan por la inhalación de polvo ambiental contaminado y partículas de aerosol de los productos del parto de animales infectados, así como por el contacto directo con la leche, la orina o las heces que contienen C. burnetii (2Y3). Los seres humanos no son considerados huéspedes naturales de C. burnetii (4). Una amplia variedad de animales pueden actuar como huéspedes (4), pero los reservorios son el ganado, principalmente ovino, vacuno y caprino (3), que son también las principales fuentes de infección humana (1).

en Senegal, C. burnetii Se ha informado en humanos (46) y garrapatas (4). Se aisló de la garrapata blanda asociada a roedores (Ornithodoros sonrai) y se detectaron en varias especies de garrapatas duras recolectadas de rumiantes (4). Nuestro estudio anterior de patógenos zoonóticos en roedores recolectados en 2017 no reveló C. burnetii en grupos de roedores de la región Ferlo del norte de Senegal (7). Sin embargo, en este estudio, analizamos muestras de roedores recolectados durante el período 2019-2020 de la misma región y encontramos una alta tasa de prevalencia de un nuevo tipo de roedor. C. burnetii genotipo, lo que puede indicar un brote epidémico en curso.

Examinamos 125 muestras de roedores C. burnetii; Se recolectaron roedores en la región de Ferlou, en el norte de Senegal, cerca de Wedou Thingoly (15,99°N, 15,32°O) en virtud de acuerdos marco entre el Instituto Nacional de Investigación para el Desarrollo de Francia y Senegal (INRAD).7). Ninguna de las especies de roedores examinadas figuraba como protegida por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza o la Convención sobre el Comercio Internacional de Especies Amenazadas de Fauna y Flora Silvestres. Los procedimientos de manipulación se realizaron en el marco del acuerdo Centre de Biologie Pour la Gestion des Populations. D-34-169-1 para realizar experimentos con animales salvajes y seguir las pautas de la Sociedad Estadounidense de Mammólogos (8).

Los roedores muestreados pertenecían a la especie Arvicanthis niloticus (n = 29), Desmodilliscus braueri (n = 3), Gerbillo nancelus (n = 9), G.Nigeria (n = 71), jaculus jaculus (n = 4), Tatrilo spp. (probablemente T. pygargus) (n = 8), f Xeros eritropus (n = 1). Extrajimos ADN del bazo como se describe en otra parte (7) y almacenado a -20 °C. Descubrimos usando ADN bacteriano C. burnetiiCebadores y sondas cuantitativas específicas para PCR en tiempo real dirigidas a los espaciadores IS1111 e IS30A (4). Para muestras positivas con un valor de umbral de ciclo <38, primero amplificamos 3 pares de cebadores espaciadores, Cox2F/R, Cox5F/R y Cox18F/R (5). Genotipado de secuenciación multiplex (MST) C. burnetii Las cepas que utilizan secuencias de la amplificación de estos tres pares de cebadores revelaron un posible nuevo genotipo. Amplificamos los otros siete pares, Cox20F/R, Cox22F/R, Cox37F/R, Cox51F/R, Cox56F/R, Cox57F/R y Cox61F/R, para describir este genotipo.

apariencia

Árbol circular sin raíz relacionado con el vecindario que ilustra la relación entre los genotipos de Coxiella burnetii descritos en un nuevo estudio de genotipo de C. burnetii que causa la fiebre Q epidémica en roedores, en el norte de Senegal.  MST75 y MST76 (rojo) se compararon con genotipos ya presentes en Senegal y MST19 y MST6 (azul) con otros genotipos.  El análisis incluyó secuencias de 64 nt.  Se han eliminado todas las posiciones que contienen lagunas y datos faltantes.  Hubo un total de 4.692 puestos de trabajo en el conjunto de datos final.  Los análisis evolutivos se realizaron en MEGA7 (https://www.megasoftware.net).  MST, escritura de secuencia multiespaciador.

apariencia. Un árbol de vecindad circular, sin raíz y conectado que muestra la relación entre Coxiella Burnetti descrito en el nuevo estudio de genotipo C. burnetiiCausó un brote de fiebre Q en roedores,…

En general, el 22,4 % (28/125 para IS1111) y el 19,2 % (24/125 para IS30A) de los roedores examinados dieron positivo para C. burnetiiPCR cuantitativa específica: Desmodilliscus braueri (33,3%; 1/3), nancelos g (33,3%; 3/9), G.Nigeria (28,2%; 20/71), jaculus jaculus (25%; 1/4) y Tatrilo spp. (37,5%, 3/8). No encontramos Arvicanthis niloticus o Xeros eritropus roedor positivo para C. burnetii. Realizamos un genotipado MST completo para positividad C. burnetii Las muestras de cepas y las secuencias obtenidas de los pares de cebadores mostraron una identidad del 100 % para todas las muestras positivas. Sin embargo, una muestra mostró una inserción de base de 5 nucleótidos en la secuencia amplificada del espaciador Cox56 (Tabla), lo que indica una posible variante. Todas estas secuencias mostraron presencia >1 de los nuevos genotipos C. burnetii Según la base de datos BLAST (https://ifr48.timone.univ-mrs.fr/mst/coxiellaburnetii/blast.html). El análisis filogenético basado en la secuenciación espaciadora reveló que los nuevos genotipos, MST75 (principal) y MST76 (con inserción), son consanguíneos y se agrupan con otros genotipos, incluidos los que ya están presentes en Senegal, como MST19, y los que infectan a los animales. y humanos, tales como MST16, MST17, MST20 y MST61 (Fig.).

lo que obtuvimos de C. burnetii Los genotipos MST75 y MST76 en la población de roedores Virlo indican el inicio de un brote epidémico de fiebre Q. predeterminado C. burnetii Las razas en Senegal estaban asociadas con la cría de ganado cerca de los pueblos de Dielmo y Ndiop (9). En Verlo, un estudio previo realizado en roedores muestreados en 2017 no encontró ningún C. burnetii (7), lo que indica un brote epidémico relativamente reciente y posiblemente aún en curso. alto C. burnetii Se observa una prevalencia (28% – 38%) en diferentes especies de jerbos, incl. G.Nigeriaque recientemente colonizó el norte de Senegal y ahora es la especie dominante en las comunidades de roedores exteriores de Ferlow (10). También se debe explorar la posibilidad de transmisión animal desde granjas ubicadas cerca del área de muestreo de roedores. Nuestro estudio muestra un nuevo surgimiento en Senegal C. burnetii genotipos en animales susceptibles, como roedores (1), que puede ser una fuente de infección humana. Aunque aún no se conoce la patogenicidad de estos nuevos genotipos en humanos, nuestros hallazgos indican la necesidad urgente de vigilancia epidemiológica de C. burnetii Infección humana en Senegal y países vecinos.

El Dr. Mangombi Bambu es investigador postdoctoral en el Instituto Universitario de Medicina Infecciosa en Marsella, Francia. Sus intereses de investigación incluyen enfermedades infecciosas de origen zoonótico, ecología y el papel de los roedores en la dinámica de las enfermedades zoonóticas.

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