Un equipo de científicos analizó la primera ola del brote de Covid-19 en el Reino Unido.

Su análisis Se basa en más de 50.000 secuencias del genoma del virus, 26.000 de ellas fueron recopiladas por Consorcio COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Proporcionar un nivel de conocimiento sin precedentes sobre los orígenes y el comportamiento de las cadenas de transmisión desde el inicio de la epidemia.

El Reino Unido tiene la suerte de albergar el consorcio de secuenciación de COVID-19 más grande del mundo que ha proporcionado información incomparable sobre la epidemiología de COVID-19. Dr. Eric Falls Autor del estudio

Análisis completoDe eruditos en universidades OxfordY el Edimburgo Y el Colegio Imperial de LondresPublicado en CienciasRevela que el virus se introdujo en el Reino Unido más de mil veces a principios de 2020 y que la tasa y la fuente de entrada cambiaron muy rápidamente.

Durante este tiempo, la mayor cantidad de cadenas de transmisión se introdujeron desde España (33%), Francia (29%), luego Italia (12%), y China representa solo el 0,4% de las importaciones. El estudio muestra cómo el bloqueo nacional en el Reino Unido ha afectado a las cadenas de transporte individuales.

El autor correspondiente y coautor principal, el profesor Oliver Pepos, del Departamento de Zoología de Oxford y Oxford Martin College, dijo: “ Este estudio muestra que es posible rastrear con precisión las cepas individuales de transmisión del virus a través del tiempo y el espacio. La realización de los análisis semanalmente significa que el rastreo genómico puede convertirse en un componente clave del monitoreo de la salud pública.

Información sobre nuevas variables

Los resultados proporcionan un contexto crítico de lo que está sucediendo ahora en la segunda ola del Reino Unido, y el equipo ayudó a identificar una nueva variable (llamada B.1.1.7) que está creciendo rápidamente en el Reino Unido.

Los científicos dicen que una comparación detallada del comportamiento de la nueva variante con el de las tensiones de la primera ola será crucial para comprender por qué B.1.1.7 se está extendiendo ahora tan rápidamente.

Antes del cierre en marzo de 2020, los altos volúmenes de viajes y las pocas restricciones a las llegadas internacionales llevaron a la creación y circulación de más de 1.000 cepas de transporte identificables en el Reino Unido, contribuyendo conjuntamente a acelerar el crecimiento de una pandemia que superó rápidamente la capacidad nacional de seguimiento de contactos.

El profesor Pepos dice: “ Al reconstruir dónde y cuándo se introdujo COVID-19 en el Reino Unido, podemos ver que las intervenciones previas de viajes y cuarentena podrían haber ayudado a reducir la aceleración y la gravedad de la primera ola de casos en el Reino Unido. ”

El equipo predice tendencias similares en otros países con epidemias relativamente grandes y grandes volúmenes de viajes internacionales.

Si bien el bloqueo nacional del Reino Unido coincidió con una importación limitada y una diversidad de linaje regional reducida, su efecto sobre la extinción del pedigrí dependió del tamaño, lo que significa que las razas más grandes y más extendidas continuaron durante el verano.

Opiniones incomparables sobre la epidemia

La naturaleza hiperproliferativa de la transmisión del SARS-CoV-2 probablemente favoreció una mayor supervivencia de linajes más grandes y más extendidos y una eliminación local más rápida de los linajes en áreas de baja prevalencia, lo que destaca la importancia de intervenciones rápidas o preventivas para reducir la transmisión.

Actualmente se está investigando el grado en que las cepas restantes contribuyeron al brote en curso en el Reino Unido en el otoño e invierno de 2020, incluido el efecto de ciertas mutaciones en las tasas de crecimiento del pedigrí.

La estructura y dinámica de transmisión que se midieron primero en este estudio proporciona un nuevo contexto en el que se deben planificar y evaluar futuras acciones de salud pública a nivel regional, nacional e internacional.

El Dr. Eric Falls, autor del estudio del Centro MRC para el Análisis de Enfermedades Infecciosas Globales en el Imperial College de Londres, dijo: “ El Reino Unido tiene la suerte de albergar el consorcio de secuenciación de COVID-19 más grande del mundo que ha proporcionado cantidades incomparables de datos genéticos e importantes conocimientos sobre COVID-19. “.

El coautor Louis de Plessis, del Departamento de Zoología de Oxford, dijo: “ Nuestro trabajo ofrece perspectivas incomparables sobre lo que está sucediendo en una sola epidemia. El Reino Unido comparte públicamente grandes cantidades de datos genéticos de virus semanalmente, y si no tiene este nivel de monitoreo, no sabrá el verdadero estado de la evolución y transmisión del virus.

La coautora Verity Hill, estudiante de doctorado de la Universidad de Edimburgo, dijo: “ Este tipo de secuenciación continua de genes coordinada a nivel nacional no solo permite el análisis de alta resolución que proporcionamos, sino que también ayuda a otros países a poner sus datos genómicos en contexto y ayudas en la respuesta global Pandemia.

La capacidad de aumentar la vigilancia genética a gran escala fue posible gracias a la decisión de financiar el consorcio COVID-19 Genomics UK (COG-UK) en abril, y a partir de décadas de investigación fundamental sobre el cielo azul en la evolución del virus, liderado por Oxford y las Universidades de Edimburgo, que desarrolló la teoría que llevó a los académicos a tener estas herramientas y teorías a su disposición.

–

“Establecimiento y dinámica de linaje de la epidemia de SARS-CoV-2 en el Reino UnidoFue publicado en la revista Ciencias

Adaptado del comunicado de prensa de la Universidad de Oxford

Consulte el comunicado de prensa de este artículo.